面對醫(yī)療機(jī)構(gòu)擁有的強(qiáng)勢的市場力量、藥品價(jià)格的行政管制與強(qiáng)制降價(jià)、刺激價(jià)格競爭的藥品招標(biāo)采購制度，中國制藥業(yè)缺乏對成本壓力有效、全面的轉(zhuǎn)移能力。尤其是政府對醫(yī)療機(jī)構(gòu)藥品購銷差價(jià)率的管制趨于嚴(yán)格，導(dǎo)致其藥品銷售業(yè)務(wù)的獲利能力顯著下降。以衛(wèi)生部門綜合醫(yī)院為例，其藥品銷售業(yè)務(wù)的毛利率由2002年的24.55%下降至2008年的16.17%。

    醫(yī)療機(jī)構(gòu)獲利能力的受限和下降，進(jìn)一步削弱了制藥業(yè)通過產(chǎn)品價(jià)格調(diào)整轉(zhuǎn)移成本壓力的可能性。數(shù)據(jù)顯示，醫(yī)藥制造業(yè)2008年的產(chǎn)品出廠價(jià)格水平基本與2001年相當(dāng)（醫(yī)藥制造業(yè)出廠價(jià)格指數(shù)2008年約為2001年的100.80%）。并且，在若干年份，受醫(yī)療機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)嫁藥品行政降價(jià)壓力和同質(zhì)競爭的影響，醫(yī)藥制造業(yè)出廠價(jià)格指數(shù)甚至出現(xiàn)同比下降。事實(shí)上，市場競爭的壓力以及醫(yī)療機(jī)構(gòu)對藥品購銷差價(jià)率管制采取的變通行為與合謀現(xiàn)象，令我們相信，制藥企業(yè)產(chǎn)品價(jià)格實(shí)際承受的轉(zhuǎn)嫁壓力，遠(yuǎn)高于醫(yī)藥制造業(yè)出廠價(jià)格指數(shù)所表現(xiàn)出來的程度。

    另一方面，制藥業(yè)低R&D強(qiáng)度及其導(dǎo)致的產(chǎn)品低附加值特征，決定了實(shí)物投入成為產(chǎn)品成本的主要構(gòu)成，從而令其難以獲得吸收成本壓力的充分緩沖。因此，在價(jià)格競爭和成本推動(dòng)的雙重?cái)D壓下，中國制藥業(yè)的盈利空間持續(xù)收窄。2008年，醫(yī)藥制造業(yè)的毛利率約為31.62%，已較2002年下降了大約4.13個(gè)百分點(diǎn)。不過，制藥業(yè)控制費(fèi)用支出的努力，在一定程度上吸收了成本結(jié)構(gòu)面臨的壓力。2008年，醫(yī)藥制造業(yè)的（3項(xiàng)）費(fèi)用率相對于2002年下降了6.92個(gè)百分點(diǎn)，從而導(dǎo)致營業(yè)利潤率相應(yīng)上升2.98個(gè)百合點(diǎn)，銷售利潤率上升1.88個(gè)百分點(diǎn)。